Al principio del siglo XVI, los españoles lograron eliminar los últimos Taínos que vivian en la isla de Vieques. Los caciques Taínos que eran hermanos, llamados Cacimar y Yahureibo, son los únicos Taínos conocidos de nombre que perdieron sus vidas a los Conquistadores. Un buen libro acerca de los Taínos en Puerto Rico en general, es el libro Taínos: Subida y declinación de la gente que saludó a Colón.
Deborah Santana escribe, "Algunos de los restos humanos más viejos descubiertos en el Caribe entero, teniendo más de 4000 años de edad, fueron encontrados en el sector La Hueca, en Vieques. Yo misma he visitado este sitio, donde fueron situados hace muchísimos años enormes piezas de granito creando un "mini Stonehenge". Es lugar parece ser un sitio sagrado y verdaderamente se siente de esa manera. Hay cientos de sitios arqueológicos en Vieques, y muchos expertos sienten que Vieques es el lugar clave para descubrir la historia indígena del Caribe". "Aunque la marina cerró sus bases en Vieques el día 1ero de Mayo del año 2003, las tierras son actualmente controladas por el "US Fish and Wildlife Service", quiénes todavía mantienen restricciones contra el uso local o el estudio científico independiente de los sitios arqueológicos."
